Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EAF1Q96JC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EAF1Q96JC9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms