Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GCC1Q96CN9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GCC1Q96CN9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms