Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SVBPQ8N300 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SVBPQ8N300 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms