Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC25A48Q6ZT89 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A48Q6ZT89 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A48Q6ZT89 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms