Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF165Q6ZSG1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms