Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED27Q6P2C8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED27Q6P2C8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms