Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf33Q6P1S2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
C3orf33Q6P1S2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C3orf33Q6P1S2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms