Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q5VSD8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q5VSD8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q5VSD8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q5VSD8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q5VSD8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q5VSD8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q5VSD8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q5VSD8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q5VSD8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q5VSD8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q5VSD8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q5VSD8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q5VSD8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q5VSD8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q5VSD8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q5VSD8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q5VSD8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q5VSD8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q5VSD8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q5VSD8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q5VSD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q5VSD8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q5VSD8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q5VSD8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q5VSD8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q5VSD8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q5VSD8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q5VSD8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q5VSD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q5VSD8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q5VSD8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q5VSD8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q5VSD8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q5VSD8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q5VSD8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q5VSD8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q5VSD8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q5VSD8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q5VSD8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q5VSD8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q5VSD8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q5VSD8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q5VSD8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q5VSD8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q5VSD8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q5VSD8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q5VSD8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q5VSD8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q5VSD8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q5VSD8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q5VSD8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q5VSD8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q5VSD8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q5VSD8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q5VSD8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q5VSD8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q5VSD8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q5VSD8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q5VSD8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q5VSD8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q5VSD8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q5VSD8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q5VSD8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q5VSD8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q5VSD8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q5VSD8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q5VSD8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q5VSD8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q5VSD8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q5VSD8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q5VSD8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q5VSD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q5VSD8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q5VSD8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q5VSD8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q5VSD8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q5VSD8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q5VSD8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q5VSD8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q5VSD8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q5VSD8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q5VSD8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q5VSD8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q5VSD8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q5VSD8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q5VSD8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms