Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM74A1Q5RGS3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM74A1Q5RGS3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM74A1Q5RGS3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms