Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRAMD1BQ3KR37 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD1BQ3KR37 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms