Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDRF1Q3B7T1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDRF1Q3B7T1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDRF1Q3B7T1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms