Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRFIP1Q32MZ4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRFIP1Q32MZ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms