Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZIC1Q15915 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIC1Q15915 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIC1Q15915 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms