Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TAF1CQ15572 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1CQ15572 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
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