Protein–RNA interactions for Protein: Q15513

SPHAR, Protein SPHAR, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHARQ15513 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPHARQ15513 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPHARQ15513 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms