Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYR3Q15413 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RYR3Q15413 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RYR3Q15413 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms