Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1D2Q14995 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NR1D2Q14995 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D2Q14995 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms