Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 PNP-208ENST00000557229 992 ntTSL 1 (best)15.61■□□□□ 0.098e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 PNP-201ENST00000361505 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.068e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.058e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.051e-10■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.048e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 SORBS3-204ENST00000517962 885 ntTSL 214.84□□□□□ -0.038e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.058e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 WDR59-223ENST00000616369 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.178e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.178e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 PNP-204ENST00000554056 1635 ntTSL 513.55□□□□□ -0.248e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.298e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 PLCG1-205ENST00000465571 543 ntTSL 213.15□□□□□ -0.38e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 TP53BP1-210ENST00000450115 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.348e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 RAB3GAP2-207ENST00000478976 575 ntTSL 412.44□□□□□ -0.428e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 TP53BP1-216ENST00000572085 5574 ntTSL 212.39□□□□□ -0.438e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 TP53BP1-211ENST00000467474 556 ntTSL 312.35□□□□□ -0.438e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 TP53BP1-207ENST00000417342 594 ntTSL 312.16□□□□□ -0.468e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 HBS1L-204ENST00000367826 2703 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.518e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 PNP-207ENST00000556754 2573 ntTSL 210.94□□□□□ -0.668e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 GTPBP4-203ENST00000483839 596 ntTSL 210.81□□□□□ -0.688e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.718e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 HBS1L-214ENST00000529641 881 ntTSL 510.42□□□□□ -0.748e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.748e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 TP53BP1-204ENST00000411772 3976 ntTSL 510.41□□□□□ -0.748e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.758e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 WDR59-203ENST00000561717 542 ntTSL 310.09□□□□□ -0.798e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.848e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 TARS-206ENST00000504698 633 ntTSL 39.58□□□□□ -0.888e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.918e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.938e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.968e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 YLPM1-205ENST00000549293 5500 ntTSL 1 (best)9.03□□□□□ -0.968e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 WDR59-219ENST00000569549 934 ntTSL 59.02□□□□□ -0.978e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.978e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 HBS1L-213ENST00000529169 633 ntTSL 38.2□□□□□ -1.18e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.118e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 PNP-203ENST00000553591 770 ntTSL 58.01□□□□□ -1.138e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.168e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 HBS1L-216ENST00000533274 2102 ntTSL 27.69□□□□□ -1.188e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 ANAPC7-207ENST00000486321 748 ntTSL 26.2□□□□□ -1.421e-10■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 HBS1L-209ENST00000526100 1600 ntTSL 26.05□□□□□ -1.448e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 TSR1-203ENST00000575049 387 ntTSL 35.84□□□□□ -1.478e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.488e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 YLPM1-203ENST00000547879 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.49□□□□□ -1.538e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 MYO1B-214ENST00000496992 561 ntTSL 45.22□□□□□ -1.578e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 CDC6-205ENST00000582402 353 ntTSL 35.16□□□□□ -1.588e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 USP10-209ENST00000563433 540 ntTSL 24.67□□□□□ -1.668e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 CAND1-204ENST00000540319 2786 ntTSL 24.14□□□□□ -1.758e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 ADSS-203ENST00000468215 807 ntTSL 23.56□□□□□ -1.848e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 CAND1-207ENST00000544619 4091 ntTSL 1 (best)3.06□□□□□ -1.928e-6■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.124e-7■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.814e-7■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.624e-7■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 CCT7-204ENST00000409924 567 ntTSL 324.93■■□□□ 1.583e-11■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 CLTC-213ENST00000584313 715 ntTSL 317.79■□□□□ 0.447e-14■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 MAGED1-205ENST00000470461 810 ntTSL 27.73□□□□□ -1.171e-7■■■■□ 20.2
G3BP1Q13283 KHSRP-206ENST00000595258 672 ntTSL 519.42■□□□□ 0.74e-14■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 FDFT1-216ENST00000529521 418 ntTSL 23.08□□□□□ -1.924e-14■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 PDLIM1-204ENST00000492511 453 ntTSL 28.91□□□□□ -0.981e-8■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 ECH1-214ENST00000601094 440 ntTSL 213.88□□□□□ -0.194e-10■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 ECH1-205ENST00000595567 308 ntTSL 311.37□□□□□ -0.594e-10■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 ECH1-206ENST00000596118 356 ntTSL 38.41□□□□□ -1.064e-10■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 ECH1-209ENST00000597805 135 ntTSL 58.37□□□□□ -1.074e-10■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 ECH1-208ENST00000597205 169 ntTSL 57.17□□□□□ -1.264e-10■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 PSME4-201ENST00000389993 6581 ntTSL 1 (best)17.92■□□□□ 0.467e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.287e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 PRMT5-210ENST00000553550 580 ntTSL 326.69■■□□□ 1.868e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 PRMT5-215ENST00000554716 561 ntTSL 425.93■■□□□ 1.748e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 LRBA-207ENST00000509835 5578 ntTSL 1 (best)8.09□□□□□ -1.114e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 LRBA-205ENST00000508396 234 ntTSL 33.47□□□□□ -1.854e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.097e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.067e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.017e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)14.26□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.297e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 NDUFA9-202ENST00000396655 1037 ntTSL 1 (best)13.73□□□□□ -0.213e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 AC005832.4-201ENST00000536588 818 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 NDUFA9-205ENST00000539573 500 ntTSL 310.91□□□□□ -0.663e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 CNDP2-208ENST00000579624 1176 ntTSL 59.7□□□□□ -0.862e-6■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 NDUFA9-204ENST00000535726 930 ntTSL 55.29□□□□□ -1.563e-7■■■■□ 20.1
G3BP1Q13283 DDX54-205ENST00000548786 498 ntTSL 219.55■□□□□ 0.725e-7■■■■□ 20
G3BP1Q13283 PSMD2-207ENST00000445558 825 ntTSL 513.2□□□□□ -0.34e-7■■■■□ 20
G3BP1Q13283 EIF4G1-234ENST00000478291 564 ntTSL 219.34■□□□□ 0.698e-11■■■■□ 20
G3BP1Q13283 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 20
G3BP1Q13283 NDUFB7-202ENST00000593353 529 ntTSL 219.03■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 20
G3BP1Q13283 PSMD1-204ENST00000431051 2506 ntTSL 1 (best)18.2■□□□□ 0.56e-7■■■■□ 20
G3BP1Q13283 TOM1-216ENST00000492723 2568 ntTSL 220.44■□□□□ 0.862e-7■■■■□ 20
G3BP1Q13283 DDX24-206ENST00000555324 810 ntTSL 1 (best)9.38□□□□□ -0.912e-9■■■■□ 20
G3BP1Q13283 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.062e-8■■■■□ 20
G3BP1Q13283 PRPF8-209ENST00000573725 749 ntTSL 57.32□□□□□ -1.241e-7■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 HNRNPM-215ENST00000601645 832 ntTSL 317.3■□□□□ 0.365e-7■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 PRPF8-206ENST00000572723 959 ntTSL 214.49□□□□□ -0.099e-8■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 MCM5-203ENST00000416905 739 ntTSL 317.07■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 MCM5-204ENST00000417343 557 ntTSL 56.38□□□□□ -1.391e-6■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 PRPF19-204ENST00000539960 796 ntTSL 216.67■□□□□ 0.263e-15■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 VCL-205ENST00000478896 727 ntTSL 516.34■□□□□ 0.213e-6■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 VARS-217ENST00000440048 804 ntTSL 1 (best)29.29■■■□□ 2.287e-7■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 PRPF8-204ENST00000572445 648 ntTSL 27.67□□□□□ -1.186e-9■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 XRCC5-204ENST00000429133 576 ntTSL 417.55■□□□□ 0.45e-7■■■■□ 19.9
G3BP1Q13283 XRCC5-203ENST00000417391 605 ntTSL 312.67□□□□□ -0.385e-7■■■■□ 19.9
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