Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAE1P78406 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAE1P78406 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAE1P78406 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAE1P78406 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAE1P78406 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAE1P78406 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAE1P78406 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAE1P78406 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAE1P78406 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAE1P78406 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAE1P78406 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAE1P78406 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAE1P78406 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAE1P78406 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAE1P78406 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAE1P78406 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAE1P78406 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAE1P78406 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAE1P78406 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAE1P78406 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAE1P78406 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAE1P78406 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAE1P78406 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAE1P78406 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAE1P78406 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAE1P78406 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAE1P78406 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAE1P78406 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAE1P78406 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAE1P78406 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAE1P78406 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAE1P78406 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAE1P78406 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAE1P78406 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAE1P78406 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAE1P78406 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAE1P78406 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAE1P78406 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAE1P78406 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAE1P78406 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAE1P78406 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAE1P78406 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAE1P78406 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAE1P78406 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAE1P78406 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAE1P78406 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAE1P78406 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAE1P78406 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAE1P78406 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAE1P78406 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAE1P78406 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAE1P78406 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAE1P78406 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAE1P78406 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAE1P78406 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAE1P78406 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAE1P78406 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAE1P78406 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAE1P78406 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAE1P78406 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAE1P78406 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAE1P78406 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAE1P78406 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAE1P78406 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAE1P78406 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAE1P78406 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAE1P78406 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAE1P78406 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAE1P78406 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAE1P78406 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAE1P78406 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAE1P78406 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAE1P78406 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAE1P78406 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAE1P78406 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAE1P78406 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAE1P78406 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAE1P78406 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAE1P78406 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAE1P78406 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAE1P78406 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms