Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB1P62873 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB1P62873 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GNB1P62873 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB1P62873 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB1P62873 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB1P62873 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB1P62873 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB1P62873 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GNB1P62873 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB1P62873 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB1P62873 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB1P62873 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB1P62873 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB1P62873 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB1P62873 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB1P62873 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB1P62873 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB1P62873 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB1P62873 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB1P62873 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB1P62873 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB1P62873 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB1P62873 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB1P62873 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB1P62873 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB1P62873 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB1P62873 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB1P62873 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB1P62873 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB1P62873 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB1P62873 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB1P62873 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB1P62873 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB1P62873 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB1P62873 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB1P62873 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB1P62873 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB1P62873 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB1P62873 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB1P62873 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB1P62873 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GNB1P62873 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB1P62873 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB1P62873 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB1P62873 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB1P62873 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GNB1P62873 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB1P62873 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB1P62873 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB1P62873 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB1P62873 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB1P62873 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB1P62873 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB1P62873 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB1P62873 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GNB1P62873 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB1P62873 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB1P62873 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB1P62873 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB1P62873 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB1P62873 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB1P62873 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB1P62873 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB1P62873 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB1P62873 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GNB1P62873 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GNB1P62873 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB1P62873 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB1P62873 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB1P62873 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB1P62873 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GNB1P62873 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms