Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCS1P62166 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCS1P62166 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NCS1P62166 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCS1P62166 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCS1P62166 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCS1P62166 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NCS1P62166 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCS1P62166 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCS1P62166 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCS1P62166 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCS1P62166 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCS1P62166 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCS1P62166 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCS1P62166 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCS1P62166 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCS1P62166 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCS1P62166 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCS1P62166 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCS1P62166 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCS1P62166 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCS1P62166 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCS1P62166 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCS1P62166 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCS1P62166 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCS1P62166 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCS1P62166 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCS1P62166 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCS1P62166 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCS1P62166 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCS1P62166 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCS1P62166 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCS1P62166 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCS1P62166 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCS1P62166 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCS1P62166 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCS1P62166 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCS1P62166 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCS1P62166 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCS1P62166 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCS1P62166 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCS1P62166 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCS1P62166 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCS1P62166 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCS1P62166 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCS1P62166 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCS1P62166 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCS1P62166 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NCS1P62166 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCS1P62166 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCS1P62166 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NCS1P62166 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCS1P62166 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCS1P62166 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCS1P62166 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCS1P62166 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCS1P62166 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCS1P62166 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCS1P62166 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCS1P62166 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCS1P62166 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCS1P62166 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCS1P62166 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NCS1P62166 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCS1P62166 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCS1P62166 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCS1P62166 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCS1P62166 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCS1P62166 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCS1P62166 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCS1P62166 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCS1P62166 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCS1P62166 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCS1P62166 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCS1P62166 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCS1P62166 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCS1P62166 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCS1P62166 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NCS1P62166 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCS1P62166 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCS1P62166 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCS1P62166 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCS1P62166 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCS1P62166 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCS1P62166 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCS1P62166 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NCS1P62166 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCS1P62166 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCS1P62166 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCS1P62166 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCS1P62166 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCS1P62166 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCS1P62166 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCS1P62166 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCS1P62166 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCS1P62166 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCS1P62166 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCS1P62166 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCS1P62166 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCS1P62166 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms