Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPZ1P61923 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPZ1P61923 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms