Protein–RNA interactions for Protein: P59827

BPIFB4, BPI fold-containing family B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB4P59827 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFB4P59827 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BPIFB4P59827 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFB4P59827 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms