Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
YBEYP58557 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBEYP58557 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBEYP58557 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBEYP58557 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBEYP58557 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBEYP58557 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
YBEYP58557 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
YBEYP58557 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBEYP58557 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBEYP58557 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBEYP58557 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBEYP58557 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBEYP58557 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBEYP58557 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBEYP58557 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBEYP58557 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBEYP58557 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
YBEYP58557 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBEYP58557 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBEYP58557 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBEYP58557 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBEYP58557 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBEYP58557 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBEYP58557 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBEYP58557 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBEYP58557 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBEYP58557 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBEYP58557 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBEYP58557 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBEYP58557 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBEYP58557 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBEYP58557 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBEYP58557 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBEYP58557 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YBEYP58557 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24■■□□□ 1.43
YBEYP58557 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
YBEYP58557 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YBEYP58557 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBEYP58557 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBEYP58557 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBEYP58557 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBEYP58557 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
YBEYP58557 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBEYP58557 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBEYP58557 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBEYP58557 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBEYP58557 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBEYP58557 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBEYP58557 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBEYP58557 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBEYP58557 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBEYP58557 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBEYP58557 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YBEYP58557 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBEYP58557 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBEYP58557 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBEYP58557 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBEYP58557 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBEYP58557 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBEYP58557 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
YBEYP58557 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YBEYP58557 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBEYP58557 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBEYP58557 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBEYP58557 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBEYP58557 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YBEYP58557 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
YBEYP58557 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBEYP58557 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBEYP58557 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBEYP58557 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBEYP58557 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBEYP58557 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YBEYP58557 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBEYP58557 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBEYP58557 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBEYP58557 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBEYP58557 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YBEYP58557 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YBEYP58557 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YBEYP58557 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YBEYP58557 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YBEYP58557 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBEYP58557 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBEYP58557 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBEYP58557 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBEYP58557 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YBEYP58557 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBEYP58557 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBEYP58557 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBEYP58557 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBEYP58557 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBEYP58557 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBEYP58557 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBEYP58557 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBEYP58557 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YBEYP58557 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YBEYP58557 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YBEYP58557 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms