Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB38P57729 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB38P57729 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB38P57729 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB38P57729 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB38P57729 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB38P57729 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB38P57729 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB38P57729 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB38P57729 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB38P57729 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB38P57729 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB38P57729 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB38P57729 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB38P57729 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB38P57729 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB38P57729 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB38P57729 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB38P57729 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB38P57729 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB38P57729 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB38P57729 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB38P57729 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB38P57729 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB38P57729 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB38P57729 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB38P57729 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB38P57729 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB38P57729 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB38P57729 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB38P57729 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB38P57729 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB38P57729 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB38P57729 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB38P57729 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB38P57729 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB38P57729 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB38P57729 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB38P57729 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB38P57729 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB38P57729 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB38P57729 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB38P57729 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB38P57729 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB38P57729 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB38P57729 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB38P57729 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB38P57729 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB38P57729 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB38P57729 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB38P57729 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB38P57729 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB38P57729 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB38P57729 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB38P57729 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB38P57729 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB38P57729 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB38P57729 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB38P57729 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB38P57729 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB38P57729 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB38P57729 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB38P57729 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB38P57729 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB38P57729 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB38P57729 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB38P57729 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB38P57729 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB38P57729 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB38P57729 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB38P57729 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms