Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCBP4P57723 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCBP4P57723 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCBP4P57723 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms