Protein–RNA interactions for Protein: P51693

APLP1, Amyloid-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1P51693 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP1P51693 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP1P51693 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP1P51693 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP1P51693 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP1P51693 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP1P51693 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP1P51693 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP1P51693 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP1P51693 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP1P51693 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP1P51693 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP1P51693 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP1P51693 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP1P51693 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP1P51693 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP1P51693 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP1P51693 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP1P51693 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP1P51693 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP1P51693 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP1P51693 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP1P51693 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APLP1P51693 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APLP1P51693 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APLP1P51693 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APLP1P51693 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APLP1P51693 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APLP1P51693 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APLP1P51693 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APLP1P51693 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APLP1P51693 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APLP1P51693 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APLP1P51693 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APLP1P51693 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APLP1P51693 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APLP1P51693 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APLP1P51693 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APLP1P51693 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APLP1P51693 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APLP1P51693 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APLP1P51693 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP1P51693 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP1P51693 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP1P51693 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP1P51693 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP1P51693 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP1P51693 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
APLP1P51693 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP1P51693 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP1P51693 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP1P51693 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP1P51693 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLP1P51693 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP1P51693 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP1P51693 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP1P51693 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP1P51693 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APLP1P51693 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP1P51693 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP1P51693 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP1P51693 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APLP1P51693 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP1P51693 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP1P51693 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP1P51693 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP1P51693 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP1P51693 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP1P51693 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP1P51693 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP1P51693 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP1P51693 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP1P51693 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APLP1P51693 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
APLP1P51693 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
APLP1P51693 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APLP1P51693 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APLP1P51693 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APLP1P51693 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APLP1P51693 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APLP1P51693 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APLP1P51693 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APLP1P51693 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APLP1P51693 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
APLP1P51693 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms