Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
NCAPD3P42695 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC42.41■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC42.38■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
NCAPD3P42695 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC42.36■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
NCAPD3P42695 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC42.27■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC42.27■■■■■ 4.36
NCAPD3P42695 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
NCAPD3P42695 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms