Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALRP27797 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALRP27797 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALRP27797 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALRP27797 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALRP27797 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALRP27797 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALRP27797 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALRP27797 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CALRP27797 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALRP27797 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALRP27797 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALRP27797 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALRP27797 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALRP27797 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALRP27797 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALRP27797 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALRP27797 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALRP27797 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALRP27797 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALRP27797 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALRP27797 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALRP27797 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALRP27797 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALRP27797 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALRP27797 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALRP27797 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALRP27797 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALRP27797 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALRP27797 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALRP27797 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALRP27797 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALRP27797 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALRP27797 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALRP27797 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALRP27797 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALRP27797 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALRP27797 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CALRP27797 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CALRP27797 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CALRP27797 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALRP27797 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALRP27797 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALRP27797 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALRP27797 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALRP27797 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALRP27797 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALRP27797 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALRP27797 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALRP27797 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALRP27797 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALRP27797 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALRP27797 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALRP27797 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALRP27797 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALRP27797 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALRP27797 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALRP27797 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALRP27797 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALRP27797 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALRP27797 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALRP27797 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALRP27797 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALRP27797 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALRP27797 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALRP27797 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALRP27797 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALRP27797 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALRP27797 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALRP27797 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CALRP27797 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALRP27797 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALRP27797 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALRP27797 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALRP27797 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALRP27797 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALRP27797 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALRP27797 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALRP27797 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALRP27797 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALRP27797 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALRP27797 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALRP27797 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALRP27797 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALRP27797 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALRP27797 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms