Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1P21675 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1P21675 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1P21675 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1P21675 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1P21675 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1P21675 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TAF1P21675 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TAF1P21675 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TAF1P21675 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TAF1P21675 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1P21675 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1P21675 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1P21675 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1P21675 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1P21675 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1P21675 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1P21675 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1P21675 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1P21675 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1P21675 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TAF1P21675 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TAF1P21675 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAF1P21675 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAF1P21675 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAF1P21675 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAF1P21675 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TAF1P21675 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF1P21675 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF1P21675 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF1P21675 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF1P21675 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF1P21675 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1P21675 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1P21675 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1P21675 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1P21675 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1P21675 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1P21675 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1P21675 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1P21675 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1P21675 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1P21675 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1P21675 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1P21675 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1P21675 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1P21675 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1P21675 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAF1P21675 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAF1P21675 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAF1P21675 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAF1P21675 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAF1P21675 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1P21675 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1P21675 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1P21675 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1P21675 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1P21675 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1P21675 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1P21675 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1P21675 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1P21675 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1P21675 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1P21675 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF1P21675 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF1P21675 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF1P21675 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1P21675 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1P21675 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1P21675 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1P21675 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1P21675 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1P21675 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1P21675 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1P21675 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1P21675 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1P21675 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1P21675 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1P21675 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1P21675 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1P21675 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1P21675 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1P21675 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1P21675 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1P21675 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1P21675 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1P21675 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1P21675 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1P21675 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1P21675 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1P21675 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1P21675 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1P21675 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1P21675 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1P21675 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1P21675 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1P21675 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1P21675 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1P21675 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1P21675 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms