Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD58P19256 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD58P19256 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD58P19256 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD58P19256 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD58P19256 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD58P19256 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD58P19256 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD58P19256 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD58P19256 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD58P19256 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD58P19256 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD58P19256 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD58P19256 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD58P19256 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD58P19256 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD58P19256 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD58P19256 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD58P19256 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD58P19256 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD58P19256 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD58P19256 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD58P19256 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD58P19256 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD58P19256 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD58P19256 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD58P19256 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD58P19256 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD58P19256 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD58P19256 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD58P19256 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD58P19256 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CD58P19256 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD58P19256 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD58P19256 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD58P19256 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD58P19256 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD58P19256 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD58P19256 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD58P19256 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD58P19256 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD58P19256 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD58P19256 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD58P19256 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD58P19256 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD58P19256 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CD58P19256 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD58P19256 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD58P19256 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD58P19256 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD58P19256 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD58P19256 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD58P19256 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CD58P19256 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CD58P19256 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD58P19256 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD58P19256 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD58P19256 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD58P19256 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD58P19256 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD58P19256 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD58P19256 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD58P19256 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD58P19256 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD58P19256 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD58P19256 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD58P19256 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD58P19256 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD58P19256 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD58P19256 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD58P19256 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD58P19256 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD58P19256 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD58P19256 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD58P19256 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD58P19256 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD58P19256 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CD58P19256 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD58P19256 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD58P19256 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD58P19256 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD58P19256 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD58P19256 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD58P19256 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD58P19256 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD58P19256 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD58P19256 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD58P19256 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CD58P19256 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD58P19256 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD58P19256 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD58P19256 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD58P19256 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD58P19256 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD58P19256 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD58P19256 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD58P19256 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CD58P19256 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD58P19256 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD58P19256 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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