Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN8P19075 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN8P19075 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN8P19075 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms