Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL2P13500 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL2P13500 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL2P13500 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL2P13500 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL2P13500 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL2P13500 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL2P13500 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL2P13500 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL2P13500 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL2P13500 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL2P13500 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL2P13500 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL2P13500 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL2P13500 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL2P13500 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL2P13500 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL2P13500 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL2P13500 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL2P13500 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL2P13500 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL2P13500 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL2P13500 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL2P13500 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL2P13500 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL2P13500 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL2P13500 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL2P13500 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL2P13500 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL2P13500 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL2P13500 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL2P13500 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL2P13500 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL2P13500 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL2P13500 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL2P13500 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL2P13500 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL2P13500 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL2P13500 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL2P13500 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL2P13500 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL2P13500 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL2P13500 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL2P13500 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL2P13500 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL2P13500 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL2P13500 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL2P13500 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL2P13500 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCL2P13500 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCL2P13500 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCL2P13500 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCL2P13500 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCL2P13500 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCL2P13500 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCL2P13500 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCL2P13500 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCL2P13500 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CCL2P13500 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL2P13500 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL2P13500 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL2P13500 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL2P13500 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL2P13500 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL2P13500 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL2P13500 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCL2P13500 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL2P13500 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL2P13500 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL2P13500 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL2P13500 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL2P13500 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL2P13500 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL2P13500 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL2P13500 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL2P13500 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCL2P13500 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL2P13500 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL2P13500 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL2P13500 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL2P13500 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL2P13500 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL2P13500 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCL2P13500 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL2P13500 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL2P13500 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL2P13500 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL2P13500 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL2P13500 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL2P13500 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL2P13500 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL2P13500 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL2P13500 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL2P13500 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL2P13500 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL2P13500 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL2P13500 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL2P13500 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL2P13500 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL2P13500 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms