Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM2P07951 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM2P07951 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM2P07951 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM2P07951 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM2P07951 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM2P07951 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPM2P07951 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM2P07951 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM2P07951 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM2P07951 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM2P07951 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM2P07951 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM2P07951 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM2P07951 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM2P07951 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM2P07951 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPM2P07951 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM2P07951 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM2P07951 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM2P07951 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM2P07951 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM2P07951 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM2P07951 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM2P07951 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPM2P07951 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM2P07951 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM2P07951 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM2P07951 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM2P07951 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM2P07951 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPM2P07951 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TPM2P07951 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TPM2P07951 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM2P07951 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM2P07951 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM2P07951 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM2P07951 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM2P07951 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM2P07951 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM2P07951 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM2P07951 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM2P07951 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM2P07951 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM2P07951 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM2P07951 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TPM2P07951 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM2P07951 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM2P07951 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM2P07951 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM2P07951 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM2P07951 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPM2P07951 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM2P07951 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM2P07951 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM2P07951 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM2P07951 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM2P07951 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM2P07951 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM2P07951 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM2P07951 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM2P07951 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM2P07951 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TPM2P07951 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPM2P07951 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPM2P07951 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPM2P07951 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPM2P07951 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPM2P07951 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPM2P07951 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPM2P07951 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM2P07951 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM2P07951 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM2P07951 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM2P07951 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM2P07951 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM2P07951 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPM2P07951 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPM2P07951 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPM2P07951 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPM2P07951 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPM2P07951 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPM2P07951 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPM2P07951 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TPM2P07951 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TPM2P07951 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM2P07951 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM2P07951 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM2P07951 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM2P07951 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM2P07951 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPM2P07951 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM2P07951 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM2P07951 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM2P07951 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM2P07951 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM2P07951 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM2P07951 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM2P07951 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM2P07951 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms