Protein–RNA interactions for Protein: O95996

APC2, Adenomatous polyposis coli protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APC2O95996 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APC2O95996 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
APC2O95996 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APC2O95996 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APC2O95996 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APC2O95996 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APC2O95996 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APC2O95996 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APC2O95996 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APC2O95996 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APC2O95996 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APC2O95996 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APC2O95996 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APC2O95996 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APC2O95996 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APC2O95996 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APC2O95996 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APC2O95996 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APC2O95996 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APC2O95996 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APC2O95996 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APC2O95996 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APC2O95996 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APC2O95996 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APC2O95996 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APC2O95996 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APC2O95996 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APC2O95996 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APC2O95996 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APC2O95996 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APC2O95996 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APC2O95996 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APC2O95996 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APC2O95996 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APC2O95996 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APC2O95996 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APC2O95996 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APC2O95996 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APC2O95996 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APC2O95996 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APC2O95996 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APC2O95996 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APC2O95996 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APC2O95996 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APC2O95996 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APC2O95996 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APC2O95996 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APC2O95996 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APC2O95996 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APC2O95996 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APC2O95996 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APC2O95996 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APC2O95996 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APC2O95996 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APC2O95996 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APC2O95996 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APC2O95996 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APC2O95996 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APC2O95996 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APC2O95996 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APC2O95996 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APC2O95996 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APC2O95996 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APC2O95996 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APC2O95996 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APC2O95996 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APC2O95996 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APC2O95996 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APC2O95996 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APC2O95996 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APC2O95996 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APC2O95996 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APC2O95996 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms