Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
S1PR4O95977 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR4O95977 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR4O95977 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 408.8 ms