Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COBLO75128 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COBLO75128 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COBLO75128 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COBLO75128 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COBLO75128 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COBLO75128 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COBLO75128 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COBLO75128 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COBLO75128 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COBLO75128 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COBLO75128 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COBLO75128 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COBLO75128 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COBLO75128 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COBLO75128 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COBLO75128 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COBLO75128 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COBLO75128 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COBLO75128 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COBLO75128 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COBLO75128 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COBLO75128 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COBLO75128 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COBLO75128 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COBLO75128 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COBLO75128 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COBLO75128 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COBLO75128 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COBLO75128 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COBLO75128 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COBLO75128 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COBLO75128 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COBLO75128 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COBLO75128 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COBLO75128 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COBLO75128 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COBLO75128 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COBLO75128 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COBLO75128 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COBLO75128 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COBLO75128 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COBLO75128 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COBLO75128 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COBLO75128 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COBLO75128 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COBLO75128 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COBLO75128 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COBLO75128 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COBLO75128 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COBLO75128 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COBLO75128 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COBLO75128 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COBLO75128 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COBLO75128 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COBLO75128 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COBLO75128 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COBLO75128 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COBLO75128 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COBLO75128 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COBLO75128 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COBLO75128 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COBLO75128 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COBLO75128 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COBLO75128 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COBLO75128 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COBLO75128 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COBLO75128 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COBLO75128 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLO75128 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLO75128 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLO75128 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLO75128 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLO75128 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLO75128 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLO75128 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLO75128 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLO75128 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLO75128 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COBLO75128 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COBLO75128 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COBLO75128 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COBLO75128 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COBLO75128 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COBLO75128 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COBLO75128 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLO75128 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLO75128 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLO75128 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLO75128 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLO75128 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLO75128 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLO75128 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLO75128 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLO75128 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COBLO75128 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COBLO75128 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COBLO75128 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
COBLO75128 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COBLO75128 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms