Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYNCRIPO60506 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNCRIPO60506 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNCRIPO60506 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms