Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMG1C9JSJ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMG1C9JSJ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BHMG1C9JSJ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHMG1C9JSJ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms