Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RIMBP3BA6NNM3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
RIMBP3BA6NNM3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
RIMBP3BA6NNM3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
RIMBP3BA6NNM3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
RIMBP3BA6NNM3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
RIMBP3BA6NNM3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RIMBP3BA6NNM3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RIMBP3BA6NNM3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RIMBP3BA6NNM3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RIMBP3BA6NNM3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RIMBP3BA6NNM3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RIMBP3BA6NNM3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RIMBP3BA6NNM3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RIMBP3BA6NNM3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RIMBP3BA6NNM3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RIMBP3BA6NNM3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RIMBP3BA6NNM3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms