Protein–RNA interactions for Protein: A6NHJ4

ZNF860, Zinc finger protein 860, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF860A6NHJ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF860A6NHJ4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF860A6NHJ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms