Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL33A6NCF5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL33A6NCF5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL33A6NCF5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms