Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC69.7■■■■■ 8.75
NISCHQ9Y2I1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC69.67■■■■■ 8.74
NISCHQ9Y2I1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC69.6■■■■■ 8.73
NISCHQ9Y2I1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC69.56■■■■■ 8.73
NISCHQ9Y2I1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC69.54■■■■■ 8.72
NISCHQ9Y2I1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69.5■■■■■ 8.72
NISCHQ9Y2I1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC69.5■■■■■ 8.72
NISCHQ9Y2I1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC69.49■■■■■ 8.72
NISCHQ9Y2I1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC69.41■■■■■ 8.7
NISCHQ9Y2I1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC69.41■■■■■ 8.7
NISCHQ9Y2I1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69.4■■■■■ 8.7
NISCHQ9Y2I1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC69.4■■■■■ 8.7
NISCHQ9Y2I1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC69.35■■■■■ 8.69
NISCHQ9Y2I1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC69.28■■■■■ 8.68
NISCHQ9Y2I1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC69.2■■■■■ 8.67
NISCHQ9Y2I1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC69.11■■■■■ 8.65
NISCHQ9Y2I1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC69.09■■■■■ 8.65
NISCHQ9Y2I1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC69.08■■■■■ 8.65
NISCHQ9Y2I1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC69■■■■■ 8.64
NISCHQ9Y2I1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.95■■■■■ 8.63
NISCHQ9Y2I1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC68.94■■■■■ 8.63
NISCHQ9Y2I1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC68.92■■■■■ 8.62
NISCHQ9Y2I1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC68.82■■■■■ 8.61
NISCHQ9Y2I1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC68.81■■■■■ 8.61
NISCHQ9Y2I1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC68.74■■■■■ 8.59
NISCHQ9Y2I1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.73■■■■■ 8.59
NISCHQ9Y2I1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC68.72■■■■■ 8.59
NISCHQ9Y2I1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC68.68■■■■■ 8.59
NISCHQ9Y2I1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.65■■■■■ 8.58
NISCHQ9Y2I1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC68.6■■■■■ 8.57
NISCHQ9Y2I1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC68.57■■■■■ 8.57
NISCHQ9Y2I1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC68.57■■■■■ 8.57
NISCHQ9Y2I1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.5■■■■■ 8.56
NISCHQ9Y2I1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC68.42■■■■■ 8.54
NISCHQ9Y2I1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC68.42■■■■■ 8.54
NISCHQ9Y2I1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC68.4■■■■■ 8.54
NISCHQ9Y2I1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC68.4■■■■■ 8.54
NISCHQ9Y2I1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC68.36■■■■■ 8.53
NISCHQ9Y2I1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC68.26■■■■■ 8.52
NISCHQ9Y2I1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.25■■■■■ 8.52
NISCHQ9Y2I1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.21■■■■■ 8.51
NISCHQ9Y2I1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.19■■■■■ 8.51
NISCHQ9Y2I1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC68.16■■■■■ 8.5
NISCHQ9Y2I1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.15■■■■■ 8.5
NISCHQ9Y2I1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC68.14■■■■■ 8.5
NISCHQ9Y2I1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC68.14■■■■■ 8.5
NISCHQ9Y2I1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC68.13■■■■■ 8.5
NISCHQ9Y2I1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC68.13■■■■■ 8.5
NISCHQ9Y2I1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC68.12■■■■■ 8.5
NISCHQ9Y2I1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC68.08■■■■■ 8.49
NISCHQ9Y2I1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.04■■■■■ 8.48
NISCHQ9Y2I1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC68.04■■■■■ 8.48
NISCHQ9Y2I1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC68.03■■■■■ 8.48
NISCHQ9Y2I1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC68.02■■■■■ 8.48
NISCHQ9Y2I1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC68.01■■■■■ 8.48
NISCHQ9Y2I1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC67.99■■■■■ 8.47
NISCHQ9Y2I1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC67.75■■■■■ 8.44
NISCHQ9Y2I1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC67.75■■■■■ 8.44
NISCHQ9Y2I1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC67.75■■■■■ 8.44
NISCHQ9Y2I1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC67.74■■■■■ 8.44
NISCHQ9Y2I1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC67.72■■■■■ 8.43
NISCHQ9Y2I1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.7■■■■■ 8.43
NISCHQ9Y2I1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC67.65■■■■■ 8.42
NISCHQ9Y2I1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC67.59■■■■■ 8.41
NISCHQ9Y2I1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.58■■■■■ 8.41
NISCHQ9Y2I1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.58■■■■■ 8.41
NISCHQ9Y2I1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC67.48■■■■■ 8.39
NISCHQ9Y2I1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.48■■■■■ 8.39
NISCHQ9Y2I1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC67.48■■■■■ 8.39
NISCHQ9Y2I1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.46■■■■■ 8.39
NISCHQ9Y2I1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC67.41■■■■■ 8.38
NISCHQ9Y2I1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC67.35■■■■■ 8.37
NISCHQ9Y2I1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC67.34■■■■■ 8.37
NISCHQ9Y2I1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC67.26■■■■■ 8.36
NISCHQ9Y2I1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC67.23■■■■■ 8.35
NISCHQ9Y2I1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC67.19■■■■■ 8.35
NISCHQ9Y2I1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC67.14■■■■■ 8.34
NISCHQ9Y2I1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC67.14■■■■■ 8.34
NISCHQ9Y2I1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC67.13■■■■■ 8.34
NISCHQ9Y2I1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC67.11■■■■■ 8.33
NISCHQ9Y2I1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.11■■■■■ 8.33
NISCHQ9Y2I1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.11■■■■■ 8.33
NISCHQ9Y2I1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC67.1■■■■■ 8.33
NISCHQ9Y2I1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.09■■■■■ 8.33
NISCHQ9Y2I1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.08■■■■■ 8.33
NISCHQ9Y2I1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.05■■■■■ 8.32
NISCHQ9Y2I1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC67.04■■■■■ 8.32
NISCHQ9Y2I1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC67.02■■■■■ 8.32
NISCHQ9Y2I1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.95■■■■■ 8.31
NISCHQ9Y2I1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.94■■■■■ 8.31
NISCHQ9Y2I1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC66.94■■■■■ 8.31
NISCHQ9Y2I1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.9■■■■■ 8.3
NISCHQ9Y2I1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.89■■■■■ 8.3
NISCHQ9Y2I1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC66.88■■■■■ 8.3
NISCHQ9Y2I1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.86■■■■■ 8.29
NISCHQ9Y2I1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC66.85■■■■■ 8.29
NISCHQ9Y2I1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.84■■■■■ 8.29
NISCHQ9Y2I1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.82■■■■■ 8.29
NISCHQ9Y2I1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC66.77■■■■■ 8.28
NISCHQ9Y2I1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC66.73■■■■■ 8.27
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