Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQV4

LAMP3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP3Q9UQV4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMP3Q9UQV4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMP3Q9UQV4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMP3Q9UQV4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMP3Q9UQV4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMP3Q9UQV4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMP3Q9UQV4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMP3Q9UQV4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMP3Q9UQV4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMP3Q9UQV4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMP3Q9UQV4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMP3Q9UQV4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMP3Q9UQV4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMP3Q9UQV4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMP3Q9UQV4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMP3Q9UQV4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMP3Q9UQV4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMP3Q9UQV4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMP3Q9UQV4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMP3Q9UQV4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMP3Q9UQV4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMP3Q9UQV4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMP3Q9UQV4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMP3Q9UQV4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMP3Q9UQV4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMP3Q9UQV4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMP3Q9UQV4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMP3Q9UQV4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMP3Q9UQV4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMP3Q9UQV4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMP3Q9UQV4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMP3Q9UQV4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMP3Q9UQV4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMP3Q9UQV4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMP3Q9UQV4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMP3Q9UQV4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMP3Q9UQV4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMP3Q9UQV4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMP3Q9UQV4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMP3Q9UQV4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMP3Q9UQV4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMP3Q9UQV4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMP3Q9UQV4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMP3Q9UQV4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMP3Q9UQV4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMP3Q9UQV4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMP3Q9UQV4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMP3Q9UQV4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMP3Q9UQV4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMP3Q9UQV4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMP3Q9UQV4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMP3Q9UQV4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMP3Q9UQV4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMP3Q9UQV4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMP3Q9UQV4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMP3Q9UQV4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMP3Q9UQV4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMP3Q9UQV4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMP3Q9UQV4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMP3Q9UQV4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMP3Q9UQV4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMP3Q9UQV4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMP3Q9UQV4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMP3Q9UQV4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMP3Q9UQV4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMP3Q9UQV4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMP3Q9UQV4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMP3Q9UQV4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMP3Q9UQV4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMP3Q9UQV4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMP3Q9UQV4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMP3Q9UQV4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMP3Q9UQV4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMP3Q9UQV4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMP3Q9UQV4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMP3Q9UQV4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMP3Q9UQV4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMP3Q9UQV4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMP3Q9UQV4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMP3Q9UQV4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMP3Q9UQV4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMP3Q9UQV4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMP3Q9UQV4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMP3Q9UQV4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMP3Q9UQV4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMP3Q9UQV4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMP3Q9UQV4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMP3Q9UQV4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMP3Q9UQV4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMP3Q9UQV4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMP3Q9UQV4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMP3Q9UQV4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMP3Q9UQV4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP3Q9UQV4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMP3Q9UQV4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMP3Q9UQV4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMP3Q9UQV4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMP3Q9UQV4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAMP3Q9UQV4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMP3Q9UQV4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms