Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SORCS3Q9UPU3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SORCS3Q9UPU3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SORCS3Q9UPU3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SORCS3Q9UPU3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SORCS3Q9UPU3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SORCS3Q9UPU3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SORCS3Q9UPU3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SORCS3Q9UPU3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SORCS3Q9UPU3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SORCS3Q9UPU3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SORCS3Q9UPU3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SORCS3Q9UPU3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SORCS3Q9UPU3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SORCS3Q9UPU3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SORCS3Q9UPU3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SORCS3Q9UPU3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SORCS3Q9UPU3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SORCS3Q9UPU3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SORCS3Q9UPU3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SORCS3Q9UPU3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SORCS3Q9UPU3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SORCS3Q9UPU3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SORCS3Q9UPU3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SORCS3Q9UPU3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SORCS3Q9UPU3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SORCS3Q9UPU3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SORCS3Q9UPU3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SORCS3Q9UPU3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SORCS3Q9UPU3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SORCS3Q9UPU3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SORCS3Q9UPU3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SORCS3Q9UPU3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SORCS3Q9UPU3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SORCS3Q9UPU3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SORCS3Q9UPU3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SORCS3Q9UPU3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SORCS3Q9UPU3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SORCS3Q9UPU3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SORCS3Q9UPU3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SORCS3Q9UPU3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SORCS3Q9UPU3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SORCS3Q9UPU3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SORCS3Q9UPU3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SORCS3Q9UPU3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SORCS3Q9UPU3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SORCS3Q9UPU3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SORCS3Q9UPU3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SORCS3Q9UPU3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SORCS3Q9UPU3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SORCS3Q9UPU3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SORCS3Q9UPU3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SORCS3Q9UPU3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SORCS3Q9UPU3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SORCS3Q9UPU3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SORCS3Q9UPU3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SORCS3Q9UPU3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SORCS3Q9UPU3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SORCS3Q9UPU3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SORCS3Q9UPU3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SORCS3Q9UPU3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SORCS3Q9UPU3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SORCS3Q9UPU3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SORCS3Q9UPU3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SORCS3Q9UPU3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SORCS3Q9UPU3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SORCS3Q9UPU3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SORCS3Q9UPU3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SORCS3Q9UPU3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SORCS3Q9UPU3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SORCS3Q9UPU3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SORCS3Q9UPU3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SORCS3Q9UPU3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SORCS3Q9UPU3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SORCS3Q9UPU3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SORCS3Q9UPU3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SORCS3Q9UPU3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SORCS3Q9UPU3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SORCS3Q9UPU3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SORCS3Q9UPU3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SORCS3Q9UPU3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SORCS3Q9UPU3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SORCS3Q9UPU3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SORCS3Q9UPU3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SORCS3Q9UPU3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SORCS3Q9UPU3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SORCS3Q9UPU3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SORCS3Q9UPU3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SORCS3Q9UPU3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SORCS3Q9UPU3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SORCS3Q9UPU3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SORCS3Q9UPU3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SORCS3Q9UPU3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SORCS3Q9UPU3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SORCS3Q9UPU3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SORCS3Q9UPU3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SORCS3Q9UPU3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SORCS3Q9UPU3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SORCS3Q9UPU3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SORCS3Q9UPU3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms