Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PNMA8BQ9ULN7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PNMA8BQ9ULN7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNMA8BQ9ULN7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNMA8BQ9ULN7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNMA8BQ9ULN7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNMA8BQ9ULN7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PNMA8BQ9ULN7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNMA8BQ9ULN7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNMA8BQ9ULN7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNMA8BQ9ULN7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNMA8BQ9ULN7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PNMA8BQ9ULN7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PNMA8BQ9ULN7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA8BQ9ULN7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA8BQ9ULN7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PNMA8BQ9ULN7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PNMA8BQ9ULN7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PNMA8BQ9ULN7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNMA8BQ9ULN7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNMA8BQ9ULN7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PNMA8BQ9ULN7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PNMA8BQ9ULN7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNMA8BQ9ULN7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PNMA8BQ9ULN7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA8BQ9ULN7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNMA8BQ9ULN7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA8BQ9ULN7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNMA8BQ9ULN7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNMA8BQ9ULN7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA8BQ9ULN7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA8BQ9ULN7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA8BQ9ULN7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNMA8BQ9ULN7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PNMA8BQ9ULN7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNMA8BQ9ULN7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNMA8BQ9ULN7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PNMA8BQ9ULN7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA8BQ9ULN7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNMA8BQ9ULN7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNMA8BQ9ULN7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNMA8BQ9ULN7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNMA8BQ9ULN7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNMA8BQ9ULN7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNMA8BQ9ULN7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PNMA8BQ9ULN7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNMA8BQ9ULN7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA8BQ9ULN7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PNMA8BQ9ULN7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNMA8BQ9ULN7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNMA8BQ9ULN7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNMA8BQ9ULN7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNMA8BQ9ULN7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNMA8BQ9ULN7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNMA8BQ9ULN7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PNMA8BQ9ULN7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNMA8BQ9ULN7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA8BQ9ULN7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA8BQ9ULN7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA8BQ9ULN7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA8BQ9ULN7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA8BQ9ULN7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA8BQ9ULN7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA8BQ9ULN7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA8BQ9ULN7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA8BQ9ULN7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA8BQ9ULN7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA8BQ9ULN7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA8BQ9ULN7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA8BQ9ULN7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA8BQ9ULN7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA8BQ9ULN7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA8BQ9ULN7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA8BQ9ULN7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA8BQ9ULN7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA8BQ9ULN7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA8BQ9ULN7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA8BQ9ULN7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA8BQ9ULN7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA8BQ9ULN7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA8BQ9ULN7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA8BQ9ULN7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA8BQ9ULN7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA8BQ9ULN7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8BQ9ULN7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA8BQ9ULN7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA8BQ9ULN7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA8BQ9ULN7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA8BQ9ULN7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA8BQ9ULN7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8BQ9ULN7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA8BQ9ULN7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA8BQ9ULN7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA8BQ9ULN7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA8BQ9ULN7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA8BQ9ULN7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA8BQ9ULN7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms