Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
CDK12Q9NYV4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CDK12Q9NYV4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CDK12Q9NYV4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CDK12Q9NYV4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
CDK12Q9NYV4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CDK12Q9NYV4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CDK12Q9NYV4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CDK12Q9NYV4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
CDK12Q9NYV4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
CDK12Q9NYV4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CDK12Q9NYV4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CDK12Q9NYV4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CDK12Q9NYV4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CDK12Q9NYV4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
CDK12Q9NYV4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
CDK12Q9NYV4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
CDK12Q9NYV4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
CDK12Q9NYV4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
CDK12Q9NYV4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CDK12Q9NYV4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CDK12Q9NYV4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CDK12Q9NYV4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CDK12Q9NYV4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CDK12Q9NYV4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC40.02■■■■■ 4
CDK12Q9NYV4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CDK12Q9NYV4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CDK12Q9NYV4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CDK12Q9NYV4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CDK12Q9NYV4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CDK12Q9NYV4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
CDK12Q9NYV4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CDK12Q9NYV4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CDK12Q9NYV4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CDK12Q9NYV4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CDK12Q9NYV4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CDK12Q9NYV4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CDK12Q9NYV4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CDK12Q9NYV4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CDK12Q9NYV4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CDK12Q9NYV4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CDK12Q9NYV4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CDK12Q9NYV4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.94
CDK12Q9NYV4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
CDK12Q9NYV4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CDK12Q9NYV4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CDK12Q9NYV4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CDK12Q9NYV4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CDK12Q9NYV4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CDK12Q9NYV4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CDK12Q9NYV4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CDK12Q9NYV4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CDK12Q9NYV4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CDK12Q9NYV4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CDK12Q9NYV4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CDK12Q9NYV4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
CDK12Q9NYV4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CDK12Q9NYV4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CDK12Q9NYV4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CDK12Q9NYV4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CDK12Q9NYV4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CDK12Q9NYV4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
CDK12Q9NYV4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CDK12Q9NYV4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CDK12Q9NYV4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CDK12Q9NYV4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CDK12Q9NYV4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CDK12Q9NYV4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CDK12Q9NYV4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CDK12Q9NYV4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CDK12Q9NYV4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CDK12Q9NYV4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CDK12Q9NYV4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
CDK12Q9NYV4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CDK12Q9NYV4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
CDK12Q9NYV4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CDK12Q9NYV4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CDK12Q9NYV4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CDK12Q9NYV4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CDK12Q9NYV4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CDK12Q9NYV4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CDK12Q9NYV4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CDK12Q9NYV4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
CDK12Q9NYV4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CDK12Q9NYV4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CDK12Q9NYV4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CDK12Q9NYV4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CDK12Q9NYV4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CDK12Q9NYV4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CDK12Q9NYV4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CDK12Q9NYV4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CDK12Q9NYV4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CDK12Q9NYV4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CDK12Q9NYV4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CDK12Q9NYV4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CDK12Q9NYV4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
CDK12Q9NYV4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CDK12Q9NYV4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CDK12Q9NYV4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CDK12Q9NYV4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms