Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAH9Q9NYC9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAH9Q9NYC9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAH9Q9NYC9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAH9Q9NYC9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAH9Q9NYC9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAH9Q9NYC9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAH9Q9NYC9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAH9Q9NYC9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAH9Q9NYC9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAH9Q9NYC9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAH9Q9NYC9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAH9Q9NYC9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAH9Q9NYC9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAH9Q9NYC9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAH9Q9NYC9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAH9Q9NYC9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAH9Q9NYC9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAH9Q9NYC9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAH9Q9NYC9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAH9Q9NYC9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAH9Q9NYC9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAH9Q9NYC9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAH9Q9NYC9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAH9Q9NYC9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAH9Q9NYC9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAH9Q9NYC9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAH9Q9NYC9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAH9Q9NYC9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAH9Q9NYC9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAH9Q9NYC9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAH9Q9NYC9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAH9Q9NYC9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAH9Q9NYC9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAH9Q9NYC9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNAH9Q9NYC9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAH9Q9NYC9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAH9Q9NYC9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAH9Q9NYC9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAH9Q9NYC9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAH9Q9NYC9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAH9Q9NYC9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAH9Q9NYC9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAH9Q9NYC9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAH9Q9NYC9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAH9Q9NYC9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAH9Q9NYC9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAH9Q9NYC9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAH9Q9NYC9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAH9Q9NYC9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAH9Q9NYC9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAH9Q9NYC9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DNAH9Q9NYC9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAH9Q9NYC9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAH9Q9NYC9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAH9Q9NYC9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAH9Q9NYC9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAH9Q9NYC9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAH9Q9NYC9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAH9Q9NYC9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAH9Q9NYC9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAH9Q9NYC9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAH9Q9NYC9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAH9Q9NYC9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DNAH9Q9NYC9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNAH9Q9NYC9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNAH9Q9NYC9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAH9Q9NYC9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAH9Q9NYC9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAH9Q9NYC9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNAH9Q9NYC9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNAH9Q9NYC9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNAH9Q9NYC9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DNAH9Q9NYC9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAH9Q9NYC9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DNAH9Q9NYC9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAH9Q9NYC9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAH9Q9NYC9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAH9Q9NYC9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DNAH9Q9NYC9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DNAH9Q9NYC9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DNAH9Q9NYC9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DNAH9Q9NYC9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DNAH9Q9NYC9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DNAH9Q9NYC9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DNAH9Q9NYC9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAH9Q9NYC9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAH9Q9NYC9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAH9Q9NYC9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAH9Q9NYC9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAH9Q9NYC9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAH9Q9NYC9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAH9Q9NYC9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAH9Q9NYC9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAH9Q9NYC9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAH9Q9NYC9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAH9Q9NYC9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAH9Q9NYC9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNAH9Q9NYC9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNAH9Q9NYC9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms