Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD7

RXFP3, Relaxin-3 receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXFP3Q9NSD7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXFP3Q9NSD7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXFP3Q9NSD7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RXFP3Q9NSD7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXFP3Q9NSD7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXFP3Q9NSD7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RXFP3Q9NSD7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RXFP3Q9NSD7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RXFP3Q9NSD7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RXFP3Q9NSD7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RXFP3Q9NSD7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RXFP3Q9NSD7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RXFP3Q9NSD7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RXFP3Q9NSD7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RXFP3Q9NSD7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RXFP3Q9NSD7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RXFP3Q9NSD7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RXFP3Q9NSD7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RXFP3Q9NSD7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RXFP3Q9NSD7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RXFP3Q9NSD7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RXFP3Q9NSD7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RXFP3Q9NSD7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RXFP3Q9NSD7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXFP3Q9NSD7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RXFP3Q9NSD7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RXFP3Q9NSD7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RXFP3Q9NSD7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RXFP3Q9NSD7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXFP3Q9NSD7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RXFP3Q9NSD7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXFP3Q9NSD7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXFP3Q9NSD7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXFP3Q9NSD7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXFP3Q9NSD7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXFP3Q9NSD7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXFP3Q9NSD7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXFP3Q9NSD7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RXFP3Q9NSD7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RXFP3Q9NSD7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RXFP3Q9NSD7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RXFP3Q9NSD7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RXFP3Q9NSD7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RXFP3Q9NSD7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXFP3Q9NSD7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXFP3Q9NSD7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RXFP3Q9NSD7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RXFP3Q9NSD7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXFP3Q9NSD7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXFP3Q9NSD7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXFP3Q9NSD7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXFP3Q9NSD7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXFP3Q9NSD7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RXFP3Q9NSD7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RXFP3Q9NSD7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RXFP3Q9NSD7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RXFP3Q9NSD7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RXFP3Q9NSD7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RXFP3Q9NSD7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RXFP3Q9NSD7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RXFP3Q9NSD7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RXFP3Q9NSD7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RXFP3Q9NSD7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RXFP3Q9NSD7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RXFP3Q9NSD7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RXFP3Q9NSD7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RXFP3Q9NSD7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RXFP3Q9NSD7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RXFP3Q9NSD7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RXFP3Q9NSD7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RXFP3Q9NSD7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RXFP3Q9NSD7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RXFP3Q9NSD7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RXFP3Q9NSD7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RXFP3Q9NSD7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RXFP3Q9NSD7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RXFP3Q9NSD7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RXFP3Q9NSD7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RXFP3Q9NSD7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RXFP3Q9NSD7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXFP3Q9NSD7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RXFP3Q9NSD7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RXFP3Q9NSD7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RXFP3Q9NSD7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RXFP3Q9NSD7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RXFP3Q9NSD7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RXFP3Q9NSD7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RXFP3Q9NSD7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RXFP3Q9NSD7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RXFP3Q9NSD7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RXFP3Q9NSD7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RXFP3Q9NSD7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RXFP3Q9NSD7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RXFP3Q9NSD7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RXFP3Q9NSD7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RXFP3Q9NSD7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RXFP3Q9NSD7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RXFP3Q9NSD7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RXFP3Q9NSD7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RXFP3Q9NSD7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms