Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL1Q9NR64 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL1Q9NR64 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL1Q9NR64 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL1Q9NR64 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL1Q9NR64 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL1Q9NR64 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL1Q9NR64 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL1Q9NR64 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL1Q9NR64 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL1Q9NR64 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL1Q9NR64 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL1Q9NR64 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL1Q9NR64 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KLHL1Q9NR64 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL1Q9NR64 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL1Q9NR64 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL1Q9NR64 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL1Q9NR64 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL1Q9NR64 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL1Q9NR64 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL1Q9NR64 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL1Q9NR64 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL1Q9NR64 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL1Q9NR64 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL1Q9NR64 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL1Q9NR64 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL1Q9NR64 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL1Q9NR64 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL1Q9NR64 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL1Q9NR64 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL1Q9NR64 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL1Q9NR64 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL1Q9NR64 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL1Q9NR64 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL1Q9NR64 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL1Q9NR64 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL1Q9NR64 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL1Q9NR64 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL1Q9NR64 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL1Q9NR64 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL1Q9NR64 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL1Q9NR64 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL1Q9NR64 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL1Q9NR64 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL1Q9NR64 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL1Q9NR64 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL1Q9NR64 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL1Q9NR64 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL1Q9NR64 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL1Q9NR64 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL1Q9NR64 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL1Q9NR64 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL1Q9NR64 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL1Q9NR64 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL1Q9NR64 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHL1Q9NR64 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL1Q9NR64 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL1Q9NR64 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL1Q9NR64 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL1Q9NR64 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL1Q9NR64 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL1Q9NR64 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL1Q9NR64 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL1Q9NR64 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL1Q9NR64 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL1Q9NR64 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL1Q9NR64 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL1Q9NR64 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL1Q9NR64 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL1Q9NR64 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL1Q9NR64 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL1Q9NR64 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL1Q9NR64 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL1Q9NR64 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL1Q9NR64 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL1Q9NR64 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL1Q9NR64 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL1Q9NR64 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL1Q9NR64 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL1Q9NR64 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL1Q9NR64 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL1Q9NR64 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL1Q9NR64 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL1Q9NR64 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL1Q9NR64 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL1Q9NR64 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL1Q9NR64 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL1Q9NR64 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL1Q9NR64 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL1Q9NR64 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL1Q9NR64 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL1Q9NR64 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL1Q9NR64 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL1Q9NR64 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL1Q9NR64 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL1Q9NR64 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL1Q9NR64 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL1Q9NR64 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL1Q9NR64 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms